De acuerdo con un reporte de la Auditoría Superior de la Federación, en el último año de gobierno de Javier Duarte el 90 por ciento de los fondos educativos federales otorgados a Veracruz fueron desviados a cuentas bancarias desconocidas.
El gobierno federal entregó a la administración de Duarte en 2016 la cantidad de mil 204 millones de pesos para infraestructura educativa y asistencia social de la Universidad Veracruzana, el Instituto de Espacios Educativos y el DIF estatal, aunque sólo 141 millones quedaron en las arcas del gobierno.
La Auditoria Superior de la Federación detectó que la Secretaría de Finanzas del estado de Veracruz aportó a esos organismos 11 millones de pesos.